- _ -

• _swig_getattr() : sim , ga
• _swig_repr() : ga , sim
• _swig_setattr() : sim , ga
• _swig_setattr_nondynamic() : ga , sim

- c -

• cells_ssa() : sim
• cloneNetwork() : ga
• compareSteadyStates() : ga
• configureContinuousLog() : ga
• configureFinalLog() : ga
• configureSteadyStateFunction() : ga
• crossoverNetwork() : ga

- d -

• deleteNetwork() : ga
• disableLogFile() : ga

- e -

• enableLogFile() : ga
• evolveNetworks() : ga

- g -

• GAeliteSelection() : ga
• GAfree() : ga
• GAgetCrossoverFunction() : ga
• GAgetFitnessFunction() : ga
• GAgetMutationFunction() : ga
• GAgetSelectionFunction() : ga
• GAhyperbolicSelection() : ga
• GAinit() : ga
• GAnextGen() : ga
• GArouletteWheelSelection() : ga
• GArun() : ga
• GAsetCrossoverFunction() : ga
• GAsetFitnessFunction() : ga
• GAsetMutationFunction() : ga
• GAsetSelectionFunction() : ga
• GAsetupNewStruct() : ga
• GAtournamentSelection() : ga
• get_value() : sim
• get_value2D() : sim
• getDerivatives() : sim
• getDerivatives2() : sim
• getImmediateParents() : ga
• getInitialValues() : ga
• getNumReactions() : ga
• getNumSpecies() : ga
• getOriginalParents() : ga
• getRatesFromSimulatedData() : sim
• getReactionRates() : ga
• getStoichiometryMatrix() : ga

- j -

• jacobian() : sim
• jacobian2() : sim

- l -

• Langevin() : sim
• lineageTrackingOFF() : ga
• lineageTrackingON() : ga

- m -

• MainCallback() : NetworkEvolutionLib
• mutateNetwork() : ga

- n -

• networkSteadyState() : ga
• new_array() : sim

- o -

• ODEevents() : sim
• ODEflags() : sim
• ODEsim() : sim
• ODEsim2() : sim
• ODEtolerance() : sim

- p -

• printNetwork() : ga
• printNetworkToFile() : ga

- r -

• randomNetworks() : ga

- s -

• set_value() : sim
• set_value2D() : sim
• setAverageInitialValue() : ga
• setCrossoverFunction() : ga
• setCrossoverRate() : ga
• setFitnessFunction() : ga
• setInitialValues() : ga
• setMutationFunction() : ga
• setMutationRateOfInitialValues() : ga
• setNetworkSize() : ga
• setNetworkType() : ga
• setNetworkTypeProbability() : ga
• setRatesFunction() : ga
• setStoichiometryFunction() : ga
• sim_create_callback() : sim
• sim_delete_callback() : sim
• SIM_PYTHON_ODE_FUNCTION() : sim
• simulateNetworkODE() : ga
• simulateNetworkStochastically() : ga
• SSA() : sim
• steadyState() : sim
• steadyState2() : sim
• swig_import_helper() : sim , ga